โปรตีนและโปรตีโอมิกส์: คู่มือห้องปฏิบัติการ
ริชาร์ด เจ. ซิมป์สัน
Cold Spring Harbor Laboratory Press: 2003 926 หน้า 250 เหรียญ (hbk), 185 เหรียญ (pbk)
ตอนนี้เว็บพนันออนไลน์ ฝากถอนไม่มีขั้นต่ำเรามีลำดับจีโนมจำนวนมากจนหมดแล้ว สิ่งเหล่านี้ทำให้เรามีรายการที่สมบูรณ์ของส่วนการทำงานของเซลล์ของสิ่งมีชีวิต สิ่งที่ยากคือการค้นหาว่าส่วนการทำงานทั้งหมดเหล่านี้ทำอะไร ฟังก์ชั่นจีโนมเป็นเรื่องเกี่ยวกับการวิเคราะห์การกระทำของยีนและปฏิสัมพันธ์ในระดับทั่วทั้งจีโนม การวิเคราะห์สี่ระดับมักถูกนำไปใช้ประโยชน์: ยีน (จีโนม), RNA ของผู้ส่งสาร (ทรานสคริปต์), โปรตีน (โปรตีโอม) และเมแทบอไลต์ (เมตาโบโลม) แม้ว่าจีโนมจะค่อนข้างคงที่ แต่ส่วนเสริมของ ‘โอม’ อื่นๆ จะเปลี่ยนแปลงไปตามสถานะทางสรีรวิทยา พัฒนาการ หรือพยาธิสภาพของสิ่งมีชีวิต
โปรตีโอมิกส์อาจเป็นสิ่งที่สำคัญที่สุด แต่ก็ยากที่สุดที่จะศึกษาอย่างครอบคลุม เหตุผลหนึ่งสำหรับสิ่งนี้ก็คือว่าโปรตีโอมมีหลายมิติ: ยีนตัวเดียวสามารถระบุผลิตภัณฑ์โปรตีนต่างๆ ได้จำนวนหนึ่ง ซึ่งตัวมันเองอาจถูกดัดแปลงภายหลังการแปลโดยพันธะโควาเลนต์ของช่วงของกลุ่มฟังก์ชันต่างๆ นอกจากนี้ โปรตีนมักเกิดขึ้นในสารเชิงซ้อนซึ่งองค์ประกอบและรูปแบบมีผลอย่างลึกซึ้งต่อทั้งกิจกรรมและความเสถียรของโปรตีน โปรตีโอมิกส์พยายามที่จะจัดการกับความซับซ้อนนี้โดยใช้เทคนิคระดับโมเลกุล เคมี และพันธุกรรมที่หลากหลาย
เล่มที่ยอดเยี่ยมนี้รวบรวมความหลากหลายนี้ และแม้ว่าเทคนิคโปรตีโอมิกจะยังห่างไกลจากความครอบคลุมในขอบเขตของพวกเขา แต่หนังสือที่มีน้ำหนักมากเล่มนี้ก็มีความครอบคลุมอย่างแน่นอนในคำอธิบายของมัน ทุกอย่างอยู่ที่นี่ตั้งแต่โปรโตคอลห้องปฏิบัติการโดยละเอียดไปจนถึงคำอธิบายที่ชัดเจนเกี่ยวกับพื้นฐานทางทฤษฎีของวิธีการที่ใช้ หนังสือเล่มนี้เป็นปัจจุบันมากที่สุด มีการอ้างอิงถึงตั้งแต่ปี 2545 และเกี่ยวข้องกับความก้าวหน้าทางเทคนิคล่าสุดเช่น microarrays โปรตีน
ริชาร์ด ซิมป์สัน ยังจัดการเรื่องเล็กๆ น้อยๆ ของประวัติศาสตร์ได้ เช่น ที่มาของชื่อคูแมสซีสำหรับสีย้อมสีน้ำเงินที่ใช้ย้อมโปรตีนในเจล (ได้รับการตั้งชื่อเพื่อระลึกถึงการพิชิต Kumasie ของอังกฤษ – เมืองหลวงของ Ashanti ในประเทศกานา – และเดิมใช้เพื่อย้อมจัมเปอร์ทำด้วยผ้าขนสัตว์) นักเก็ตดังกล่าวทำให้หนังสือเล่มนี้เป็นมากกว่าคู่มือห้องปฏิบัติการที่ยอดเยี่ยม ยังเป็นหนังสือที่น่าอ่านอีกด้วย
นอกจากนี้ หลักการแปรผันที่เสนอในฐานะที่เป็นพื้นฐานของฟิสิกส์นั้นเกี่ยวข้องกับเมตริกซ์เทนเซอร์ในการเพิ่มและลดดัชนีเพื่อสร้างสเกลาร์ และด้วยเหตุนี้จึงสร้างรากฐานของทฤษฎีถึงความแปรปรวนของความเร็วแสง (เมตริกกำหนดความเร็วของการแพร่กระจายคลื่น) เราไม่ได้รับเหตุผลว่าทำไมสมมาตรที่หักใดๆ ที่เกี่ยวข้องกับคำตอบพิเศษของสมการที่เป็นผลลัพธ์ จะให้คำอธิบายเชิงสาเหตุสำหรับความเร็วแสงที่แตกต่างกัน — แต่รูปแบบนี้เป็นสมมติฐานตามอำเภอใจของทฤษฎี VSL และนอกเหนือจากส่วนของการกระทำที่กำหนดความแปรผันของความเร็วของแสง (โดยไม่ขึ้นกับสมการของแมกซ์เวลล์) การเกิดขึ้นอย่างชัดเจนของความเร็วของแสงในหลักการแปรผัน VSL ที่เสนอนั้นอยู่ในอัตราส่วนกับค่าคงที่โน้มถ่วงGเท่านั้น ดังนั้นนี่คือ เพียงแค่แตกต่างกัน-ทฤษฎี Gปลอมตัว
การพัฒนาที่สามารถทำให้ VSL
ทำงานได้ เช่น การตรวจสอบเพิ่มเติมเกี่ยวกับความแปรผันของเวลาของค่าคงที่ของโครงสร้างแบบละเอียด ของทฤษฎีสองเมตริก รุ่นที่เปลี่ยนแปลงของกลุ่มสมมาตรที่อยู่ภายใต้ทฤษฎีสัมพัทธภาพ หรือผ่านแรงจูงใจในทฤษฎีสตริงเพื่อการแปรผัน ค่าคงที่” จำเป็นต้องสร้างความสัมพันธ์ที่ชัดเจนกับการวัดพื้นที่และเวลา ตลอดจนเหตุผลทางกายภาพ (ตามสมการของแมกซ์เวลล์บางรุ่น) เพื่อให้ความเร็วแสงแปรผัน น่าเสียดายที่ Magueijo ไม่ได้กล่าวถึงความคืบหน้าในทิศทางเหล่านี้โดยคนงานอื่นที่ไม่ใช่ตัวเขาเองและผู้ทำงานร่วมกันของเขาเอง
ปัญหารุนแรงที่สุดเมื่อทาเวิร์นจัดการกับการวิพากษ์วิจารณ์ทางปัญญาเกี่ยวกับแนวปฏิบัติทางวิทยาศาสตร์และวิทยาศาสตร์ประเภทต่างๆ เมื่อสังเกตเห็นการเรียกร้องให้มี “วิทยาศาสตร์ที่เป็นประชาธิปไตยมากขึ้น” เขายอมรับว่าประชาชนและตัวแทนมีบทบาทสำคัญในการพัฒนาวิทยาศาสตร์ แต่ (ในรูปแบบการโต้แย้งที่ซ้ำซากตลอดทั้งเล่ม) เมื่อยอมรับประเด็นสำคัญนี้ เขาก็บ่อนทำลายมันทันทีโดยตำหนิผู้ที่กำลังทำงานเพื่อทำให้วิทยาศาสตร์ตอบสนองต่อความสนใจของสาธารณชนและความกังวลมากขึ้นสำหรับการ “ขับเคลื่อนนักวิทยาศาสตร์ไปสู่การป้องกัน” ข้อกล่าวหานี้ลดประเด็นสำคัญของการอภิปรายเชิงสร้างสรรค์ในทันที เกี่ยวกับวิธีการที่นโยบายวิทยาศาสตร์ควรดำเนินการในระบอบประชาธิปไตยขั้นสูง ไปสู่การขัดแย้งระหว่าง “เรากับพวกเขา” หรือ (แย่กว่านั้น) “เหตุผลกับความไม่สมเหตุสมผล”
การคิดค้นตัวเลขสุ่มเพื่อสร้างกระบวนการทางกายภาพที่สมดุลอย่างแม่นยำนั้นไม่ใช่เรื่องง่าย ตัวอย่างเช่น การโยนเหรียญ — เป็นกระบวนทัศน์ที่ดูเหมือนสุ่ม — จริง ๆ แล้วมีความเอนเอียงอย่างละเอียดเนื่องจากความไม่สมดุลของมวลที่เกิดจากการออกแบบที่แตกต่างกันทั้งสองด้านของเหรียญ แม้ว่าจะได้รับการออกแบบมาอย่างพิถีพิถันเพื่อลดความลำเอียงและสิ่งประดิษฐ์อื่นๆ เครื่องกำเนิดฮาร์ดแวร์จำเป็นต้องใช้อัลกอริธึม ‘การฟอกสีฟัน’ เพื่อรักษาความสัมพันธ์ที่ตกค้าง และการทดสอบทางสถิติเพื่อตรวจหาความล้มเหลวที่อาจเกิดขึ้นในการสุ่ม ซึ่งสามารถตรวจสอบได้โดยใช้คอมพิวเตอร์เท่านั้น ซึ่งขึ้นชื่อว่าไม่สามารถสร้างตัวเลขสุ่มที่แท้จริงได้! ดังนั้น เครื่องกำเนิดตัวเลขสุ่มที่เชื่อถือได้และมีประสิทธิภาพมากกว่าจึงไม่สามารถพึ่งพาฮาร์ดแวร์หรือซอฟต์แวร์เพียงอย่างเดียวได้ แต่ควรใช้ทั้งสองอย่างรวมกันเว็บพนันออนไลน์ ฝากถอนไม่มีขั้นต่ำ
